《十三机兵防卫圈》将会以13位主角的视角来讲述故事的发展。《十三机兵防卫圈》的故事背景设定在现代的日本，而在一场名为“那一天（that day）”的事件后绝望席卷了整个区域。然而，初生牛犊不怕虎，一位名叫“鞍部十郎”的男孩站了出来并发起了反击。